过渡金属有机化学之氧化加成反应类型二

过渡金属有机化学之氧化加成反应类型二：

都可以。

要求：

  富电的金属中心具有不饱和度。金属中心越富电子越易反应。

  配体最好是强给体，最好不要是配体。

  高氧化态稳定。

  有空位置使得新键的形成成为可能。

  键越弱越易反应。

机理：

特点：

非常感慨，“闲逛” NCS顶刊、一二区高IF期刊，随便扫两眼，都会与“计算模拟”邂逅。近年来，计算模拟技术飞速发展，在物理、化学、生命科学、材料科学等众多领域得到了广泛的应用，涉及计算模拟工作的文章数量激增，paper界大有不做点模拟都不好意思发文章的趋势······

众所周知，计算模拟堪称提升文章档次的“神器”，不仅能让您的paper“登高一分区”，让您的研究内容 “更上一层楼”，还能让您的学术水平“一览众山小”。

公司简介

中科科翼(北京)科技有限公司(公司使命:让科研更容易)，中关村高新技术企业，由中科院教授、博士联合创立，是一家专注于科学计算模拟、实验室信息化服务的科技型企业。

公司联合中国科学院（大学）、清华大学、北京大学、浙江大学等国内顶尖计算模拟团队，为高校及科研院所课题组、研发企业等客户提供化学科学、生命科学、材料科学、化学工程等领域的科学计算模拟技术咨询、技术培训及项目代算等服务，助益深入理解科研课题的科学本质，有效提升科研论文发刊质量，加速科学研究进程，助力科学技术发展。

目前已服务近百所高校及科研院所，如中国科学院大学、北京大学、清华大学、复旦大学、中国科学技术大学、武汉大学、浙江大学、厦门大学、四川大学、北京化工大学、中南大学、山东大学、湖南大学、同济大学、华南理工大学、北京理工大学、合肥工业大学、北京交通大学、北京工业大学、中央名族大学、宁夏大学等高校；以及中国科学院化学研究所、上海硅酸盐研究所、兰州化学物理研究所、宁波材料所等科研院所。

服务内容之“项目代算”

1.量子化学从头计算

简介：

量子化学从头计算可以提供化合物电子结构信息，分析反应路径，预测化合物光谱和各种性质，量子化学从头计算软件可在不同型号的大型计算机，超级计算机，工作站和个人计算机上运行。与分子显示软件连用可以提供精美的分子结构和分子轨道图片。

主要功能：

化合物稳态结构的确定，如中性分子、自由基、阴、阳离子等；热力学分析，如熵变、焓变、吉布斯自由能变、键能分析及原子化能等；计算化学反应过程，如稳态及过渡态结构确定、反应热、反应能垒、反应机理及反应动力学等；计算并分析分子轨道；计算原子电荷、电势、偶极矩；振动频率分析及计算各大光谱，如IR, Raman, NMR, UV/Vis, VCD, ROA, ECD, ORD, XPS, EPR, Franck-Condon及超精细光谱等；计算极化率和超极化率；计算激发态结构及相关性质，如激发态结构确定、激发能、跃迁偶极矩、荧光光谱、磷光光谱、势能面交叉研究等；计算周期体系的能量，结构和分子轨道；计算分子间相互作用，如氢键及范德华作用。

2.材料化学模拟

简介：

针对材料科学领域研究者的科研需求，可以开展材料的电子结构计算、第一性原理计算、分子动力学模拟、建立分子的三维模型。以可视化方式对各种晶体、无定型以及高分子材料的性质及相关过程进行深入的研究。

主要功能：

搭建各种高分子、无定型聚合物、晶体以及界面模型，对小分子、高分子、晶体以及无定型聚合物等进行结构优化，得到合理的3D分子模型，键能、键长、键角以及相应的振动模式，HOMO和LUMO轨道，红外谱图和拉曼谱图等；计算多个物质间（小分子间、无定型聚合物间、界面间等）的相互作用能、结合能，包括分子间相互作用（氢键、静电相互作用等），化学键相互作用（共价键、配位键、离子键等）。对体系进行分子动力学模拟，体系平衡后，对体系中的物质进行RDF（径向分布函数）分析，MSD（均方根位移）分析，键长、键角以及末端距等结构变化分析等。分析化学反应过程，搜索反应的过渡态，从化学反应的热力学和动力学角度去判断化学反应的过程、反应的难易程度等；计算化学反应的势能变化（△E），焓变（△H），自由能变化（△G）等。模拟不同压力和温度等条件下，吸附剂骨架对吸附质分子的吸附过程，得到饱和吸附量、吸附的最佳位点、吸附能、吸附热等，判断骨架与分子的吸附形式（物理吸附与化学吸附）；

X射线衍射分析。

3.第一性原理计算

简介：

第一性原理计算是目前材料模拟和计算物质科学研究中最流行的方法之一。针对周期性或非周期性材料，开展第一性原理计算，获得材料的电子结构信息，对材料性质开展预测。

主要功能：

采用周期性边界条件(或超原胞模型)处理原子、分子、团簇、纳米线(或管)、薄膜、晶体、准晶和无定性材料，以及表面体系和固体；计算材料的结构参数(键长,键角,晶格常数，原子位置等)和构型；计算材料的状态方程和力学性质(体弹性模量和弹性常数)；计算材料的电子结构(能级、电荷密度分布、能带、电子态密度和ELF)；计算材料的光学性质；计算材料的磁学性质；计算材料的晶格动力学性质(声子谱等)；表面体系的模拟(重构、表面态和STM模拟)；从头分子动力学模拟；计算材料的激发态(GW准粒子修正)。

4.Gromacs

简介：

用于研究生物分子体系的分子动力学程序包。它可以用分子动力学、随机动力学或者路径积分方法模拟溶液或晶体中的任意分子，进行分子能量的最小化，分析构象等。它的模拟程序包包含GROMACS力场(蛋白质、核苷酸、糖等)，研究的范围可以包括玻璃和液晶、到聚合物、晶体和生物分子溶液。GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件，其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势。

主要功能：

计算结构和自由能；轨迹分析和均方位移；计算粘度；计算键长、键角、二面角；二面角主成分分析；氢键分析。

5.Lammps

简介：

主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟工作，可以模拟液体中的粒子，固体和汽体的系综。也可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子，聚合物，生物，金属，粒状和粗料化体系。LAMMPS可以计算的体系小至几个粒子，大到上百万甚至是上亿个粒子。

主要功能：

计算结构和自由能；轨迹分析和均方位移；计算粘度；计算键长、键角、二面角；二面角主成分分析；氢键分析。

6.Amber

简介：

Amber是一个多个程序的集合包，大约包含50多个程序，相互协调工作，包含代码和演示的分子模拟软件包，由AmberTools和Amber组成，在多糖、核酸、蛋白质、质膜的模拟中有广泛应用。

主要功能：

计算结构和自由能；轨迹分析和均方位移；RMSD分析；RMSF分析；Cα角的分析；计算键长、键角、二面角；二面角主成分分析；氢键分析。

7.Autodock

简介：

Autodock是一款开源的分子对接软件，最主要应用于执行配体—蛋白分子对接，可以用于构建药物-靶标复合物结构、开展虚拟筛选研究。

主要功能：

刚性对接、半柔性对接、X-射线晶体学；基于结构的药物设计；先导化合物优化；虚拟筛选；组合库设计；蛋白—蛋白对接；化学机制研究。

8.有元限模拟计算

简介：

应用有限元模拟软件，在化学、力学、电磁场、流体、传热、化工、MEMS、声学等领域开展模拟分析，描述电化学过程、材料的力学性能、物质、能量动量的输运等。

主要功能：

电磁学；结构力学、声学；流体流动、传热；化工；多功能；接口产品。

9.XRD单晶数据解析

简介：

使用olex2软件解析单晶数据，可得到晶体结构及相应的晶体参数，并提供相应的二维图像

主要功能：

晶体的晶胞参数和结构的确立；物相鉴定，定量分析物相；测残余应力、晶粒尺寸、结晶度和织构分析；测原子径向分布函数；健长、健角、原子的占位情况与占有率等。

应千百客户要求，中科科翼团队（由中科院教授、博士组成）近期将“与‘翼’俱进”计算模拟系列课程。本课程涵盖众多主流计算模拟专业软件，涉及化学、生物、材料等众多领域，每天10分钟，学习计算模拟技术，专注更专业，从入门到精通，轻松carry，让科研更容易！

线上课程（科翼公众号、网易云课堂、b站、科翼官网、荔枝微课、腾讯课堂、淘宝、直答理工等平台）

目前更新课程：

分子力学软件：

支持GPU加速、增强采样算法、自由能预测、QM/MM等方法。在蛋白质、多肽、多糖、核酸、磷脂等生物分子的模拟中有广泛应用。

量子化学从头计算软件：

近年来，越来越多的实验工作者也借助量子化学计算辅助来辅助实验工作。其输入文件简单明了，极易书写；计算功能强大，满足绝大多数量化计算需求；计算速度也在众多量化软件中也名列前茅；因此深受广大计算化学从业者喜爱。课程包括利用可视化软件搭建分子结构，进行计算结果的可视化分析。量子化学计算的基本操作，方法和基组的选择，结果分析等。

材料化学模拟软件

Materials Studio是具备多种先进算法的综合应用使成为一个强有力的模拟工具。无论构型优化、性质预测和X射线衍射分析，以及复杂的动力学模拟和量子力学计算，我们都可以通过一些简单易学的操作来得到切实可靠的数据。该教程是Materials Studio分子模拟计算平台的一个初级教程，涉及到软件与理论简介、分子模型建立、分子动力学及量子化学计算案例，可以快速帮助初学者入门MS的基础操作，加速自己的研究进展。

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长期招聘

计算模拟技术工程师（可兼职）

岗位基本要求：

1.学历要求:硕士研究生及以上；

2.在sci核心期刊发表过内容与计算模拟相关论文；

3.至少熟练使用某一领域某一种计算模拟软件；

4.具备一定的单独开展计算模拟项目的能力；

5.具备软件讲授能力者可同时担任培训讲师并获得相应待遇。

薪资待遇:

按参与项目情况获得酬劳，服务能力强者获得提成及奖励，入职满一年者，发放中科科翼特聘专家证书。

计算模拟技术培训讲师（可兼职）

岗位基本要求：

1.学历要求:硕士研究生及以上；

2.在sci核心期刊发表过内容与计算模拟相关论文；

3.至少熟练使用某一领域某一种计算模拟软件；

4.有很好的语言表达能力及逻辑思维能力；

5.具备项目执行能力者可同时担任技术工程师并获得相应待遇。

薪资待遇:

按开展培训获得酬劳，服务能力强者获得提成及奖励，入职满一年者，发放中科科翼特聘专家证书。

校园合伙人

岗位基本要求：

1.本科及以上学历，熟悉大学生群体，有实际运营经验优先；

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